紫禁惊雷故事发生在清康熙年间。自幼孔武有力的聂多宝（马浚伟 饰）因与蓝翎侍卫尔豪发生冲突，引发满汉冲突，康熙（陈国邦 饰）为不使争端升级，下令汉人也可投考御前侍卫，后因孝庄（程可为 饰）太后阻挠而搁浅。顺治临终前留下书信一封，福全（马国明 饰）认为此信肯定牵扯到谁来继承皇位的问题，追查中得知信已遗失，于是他滥杀无辜，并将罪责全部推在孝庄、康熙等人身上，令头脑简单的多宝误入歧途。一个偶然机会，多宝听人谗言，说康熙是逼害自己家人的仇人，他想利用康熙南巡途中将其诛杀，但经过激烈的思想斗争最终没有下手，康熙念其护驾有功，升他为侍卫统领。此时，继位无望的福全终于发难了......